從COVID-19疫苗中,了解其中生物科學中心法則的延伸應用

本篇要點:

  • 目前有上市/即將上市的COVID-19 疫苗,可分哪幾大類?
  • DNA或RNA疫苗,如何參與免疫演習?
  • 藉由中心法則轉訊並解譯,COVID-19 疫苗中的情資?什麼是生物科學的中心法則?
  • 如何將生物科學的中心法則概念,延伸應用到COVID-19 疫苗?

COVID-19疫苗用何種方式,保存病原體的情資?

目前COVID-19疫苗各家廠商,將COVID-19的機要情資,以不同的方式傳遞。

  • 以DNA為傳遞資訊的腺病毒疫苗: Covishield (印度血清研所;The Serum Institute, SII)、 AZD122 (阿斯特捷利康;AstraZeneca, AZ)、Ad26.COV2.S (美國嬌生集團旗下的楊森製藥; Janssen)
  • 以RNA為媒介的mRNA疫苗: BioNtech (輝瑞;Pfizer) 、mRNA1273 (莫德納;Moderna)
  • 以重組蛋白質手段,來表達COVID-19棘蛋白片段的次單位疫苗: NVX-CoV2373 (諾瓦瓦克斯醫藥;Novavax)
  • 將COVID-19病毒株滅活的不活化疫苗: CoronaVac (科興;Sinovac Biotech ) Sinopharm(國藥集團;Sinopharm)

 


用DNA或RNA為訊息媒介的疫苗,要如何將所載情資,轉訊並投放至免疫演習場中?

不同於次單位及不活化疫苗,直接向體內提供棘蛋白或病源珠的結構,且不需轉訊,直上演習場訓練;以DNA或RNA為訊息傳遞媒介的COVID-19疫苗,則是需要細胞先做轉訊情資的任務。細胞如何執行轉訊的解密任務呢?

⇒ 藉由生物萬用解密程序──生物科學的中心法則:
DNA(去氧核醣核酸deoxyribonucleic acid)→ mRNA 核醣核酸(ribonucleic acid)→ Protein(蛋白質)

簡介生物科學的中心法則,是如何進行的?

  • 第一階段DNA mRNA

在細胞核內的DNA,通過RNA聚合酶(RNA polymerase) 協助,原物料──核糖糖酸們(A、U、C、G),執行轉錄(transcription),將DNA所載的資訊轉化成RNA。被轉錄出的RNA種類包含mRNA(信使RNA;messenger RNA)tRNA(轉運核糖核酸;transfer RNA)rRNA核糖體RNA(ribosomal RNA)

其三者的腳色為:mRNA序列中,所乘載的資訊可轉訊成蛋白質;tRNA協助mRNA轉訊;rRNA會與核醣體結合,其組合為mRNA轉訊成胜肽時所需的場地。

以下,簡述mRNA的在細胞如何執行轉訊前的修飾作業。轉錄出的初級mRNA會在細胞核內,進行轉錄後修飾,其步驟有三大項。

  1. RNA剪接(RNA splicing)
    RNA序列的資訊可分為,乘載轉訊情資的外顯子(Exon),以及可能具基因表達調控功能的內含子(intron)。在原則上會選擇性保留外顯子,移除序列中的內含子。但因在RNA剪接過程中,可能會選擇保留不同的外顯子片段,則產生選擇性剪接(alternative splicing)現象,也因此會輸出不同的mRNA異構物(isoform)。
  2. 在mRNA的五端進行加帽儀式(5’ capping)
  3. 在mRNA的三端進行多腺苷酸化(3’ poly-adenylation)

初級轉錄mRNA完成轉錄後修飾,會升級為成熟的mRNA。才會藉由細胞核上的小通道,跑出細胞核到細胞質遊蕩。

另註:具有特定功能的RNA,會在細胞質進行折疊或組裝,這些RNA具有二級結構的特性(如:tRNA、rRNA)。

  • 第二階段 mRNA→peptide

已經在細胞質中mRNA,會接洽mRNA轉訊工廠──核糖體(ribosome)。在得到廠方協助後,進行媒合轉訊成胜肽的任務,以及在此招募特定的打工仔與原物料──tRNA與胺基酸(amino acid)組合。

被招募的tRNA,其自身上的反密碼子(anticodon),與mRNA上的密碼子(codon)可相互對應,而此被招募的tRNA上,會有呼應序列的特定胺基酸(amino acid)。因此藉此機制,被招募的tRNA可運送與密碼子所對應的胺基酸(原物料),到此來合成胜肽。

mRNA-tRNA藉核糖體媒合成功後,會將tRNA所帶來的胺基酸,與前一個被媒介且停留在產線上的胺基酸,用藉著肽鍵(peptide bond),將前後的胺基酸串聯。而被串聯的胺基酸們,我們稱之為胜肽(peptide)。這時,在此完成媒合任務後的tRNA,才會打卡下班,離開核糖體。

tRNA下班後,廠方(核糖體)還會再招募符合條件的打工仔(tRNA),重複上述操作。直到遇到mRNA的停止令──終止密碼子(Stop codon)。當mRNA提出提主終止轉訊要求後,核糖體的廠房才會就地解散,mRNA也會離去,再度自在的遊盪於細胞質中;其輸出的產品胜肽,亦會隨著廠房的瓦解而離去,並在細胞中執行下一階的任務。

以上所述在生物學中,稱之為轉譯(translation)──也就是RNA轉訊為胜肽的過程。

  • 第三階段 peptide→ protein

被輸出的胜肽會在特定點(如:細胞質、內質網(Endoplasmic reticulum)等),進行折疊及組裝,完成蛋白質的初始型態。但非一定具有功能性。因為有些蛋白質還需要轉譯後修飾(如:醣基化(Glycosylation)甲基化(methylation)泛素化(ubiquitination));亦有些蛋白質需要酵素催化後,才會具有功能性。蛋白質也會因應本命的腳色的不同,分布在細胞內、錨定在細胞膜上、回歸細胞核或分泌至細胞外。


統整概念|藉由生物科學的中心法則,轉訊並解譯COVID-19 疫苗內藏的情報

因此,細胞也會依照生物學的中心法則的概念,將DNA或RNA疫苗所載棘蛋白的序列,在細胞內轉訊棘蛋白。

 


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